Βαθμολογίες πολυγονικού κινδύνου στην κλινική πράξη;  Ακόμα Κάνοντας την Υπόθεση |  Blogs

Βαθμολογίες πολυγονικού κινδύνου στην κλινική πράξη; Ακόμα Κάνοντας την Υπόθεση | Blogs

Juli 5, 2022 0 Von admin

μια καμπύλη βαθμολογίας πολυγονικού κινδύνου με διπλή έλικα, ένας γιατρός που δείχνει ένα tablet με εικονίδια που το περιβάλλουν και ένας γιατρός που μιλά στον ασθενή τηςΔύο πρόσφατες συστηματικές ανασκοπήσεις δείχνουν την έλλειψη δεδομένων σχετικά με την κλινική χρησιμότητα των βαθμολογιών πολυγονιδιακού κινδύνου και σημαντικές προκλήσεις στην εφαρμογή.

The Promise of Polygenic Risk Scores in Population Health

Πολλές κοινές ασθένειες όπως ο καρκίνος, ο διαβήτης και οι καρδιακές παθήσεις, προκύπτουν από το συνδυασμό γενετικών παραγόντων και φυσικών και κοινωνικών περιβαλλοντικών παραγόντων. Μελέτες συσχέτισης σε επίπεδο γονιδιώματος (GWAS) έχουν εντοπίσει πολλές γενετικές παραλλαγές με σχετικά μικρά μεγέθη ατομικών επιδράσεων. Για να εκτιμήσετε τον γενετικό κίνδυνο ενός ατόμου για μια συγκεκριμένη ασθένεια, βαθμολογία πολυγονικού κινδύνουΤα s (PRS) υπολογίζονται προσθέτοντας τον αριθμό των παραλλαγών γενετικού κινδύνου που έχει ένα άτομο, σταθμισμένο με το μέγεθος του αποτελέσματος. Ο συνδυασμός PRS με φυσικούς και κοινωνικούς περιβαλλοντικούς παράγοντες κινδύνου μπορεί να οδηγήσει σε καλύτερη διαστρωμάτωση κινδύνου.

Πολλαπλές μελέτες έχουν διερευνήσει τη χρήση του PRS στη διαστρωμάτωση κινδύνου, τον προσυμπτωματικό έλεγχο, την πρόβλεψη και τη θεραπεία χρόνιων ασθενειών. Ωστόσο, μέχρι σήμερα δεν έχει υπάρξει ισχυρή αποδεικτική υποστήριξη για τη συνήθη χρήση τους στην κλινική πρακτική και στην πρακτική της δημόσιας υγείας. Ακόμα δεν γνωρίζουμε πώς να ενσωματώσουμε καλύτερα αυτό το PRS στην υγειονομική περίθαλψη.

Κλινική εγκυρότητα έναντι κλινικής χρησιμότητας

Η κλινική εγκυρότητα ενός τεστ αναφέρεται στην ακρίβειά του στον προσδιορισμό της κλινικής κατάστασης ενός ασθενούς, ενώ η κλινική χρησιμότητα αναφέρεται στην ικανότητά του να βελτιώνει τα αποτελέσματα της υγείας, λαμβάνοντας υπόψη τόσο τα πιθανά οφέλη όσο και τους κινδύνους. Πολλές μελέτες έχουν αποδείξει την κλινική εγκυρότητα του PRS για διάφορες ασθένειες. Αυτό είναι ένα σημαντικό βήμα επειδή το GWAS εντοπίζει τις επιδράσεις των γενετικών παραλλαγών μεμονωμένα, όχι σε συνδυασμό όπως στο PRS. Ωστόσο, δεν υπάρχουν στοιχεία σχετικά με την κλινική χρησιμότητα του PRS για διάφορες ασθένειες. Εάν θέλουμε το PRS να κάνει ουσιαστική διαφορά στην υγεία του πληθυσμού, οι μελέτες σχετικά με την κλινική εγκυρότητα που καταδεικνύουν διαφορές στην κατανομή κινδύνου μεταξύ προσβεβλημένων και μη προσβεβλημένων ομάδων είναι μόνο ένα σημείο εκκίνησης.

Σε μια πρόσφατη συστηματική αξιολόγηση Από τα υπάρχοντα στοιχεία για την κλινική χρησιμότητα του PRS, 22 από τα 591 άρθρα που εξετάστηκαν παρείχαν ισχυρές ενδείξεις κλινικής εγκυρότητας, αλλά κανένα άρθρο δεν απέδειξε κλινική χρησιμότητα. Προς την παράγουν στοιχεία για κλινική χρησιμότητα, απαιτούνται προοπτικές μελέτες και τυχαιοποιημένες ελεγχόμενες δοκιμές. Οι συγγραφείς της συστηματικής ανασκόπησης κατέληξαν στο συμπέρασμα ότι δεν είμαστε έτοιμοι να ενσωματώσουμε το PRS σε κλινικά περιβάλλοντα.

Clinical Utility: Cost Effectiveness, Transferability and Equity

Απαιτούνται μελέτες κόστους-αποτελεσματικότητας σχετικά με τη χρήση του PRS σε περιβάλλοντα με βάση τον πληθυσμό για την παροχή στοιχείων για κλινική χρησιμότητα. Το δεύτερο πρόσφατη συστηματική ανασκόπηση αξιολόγησαν αναλύσεις κόστους-αποτελεσματικότητας για τη χρήση του PRS για προσυμπτωματικό έλεγχο καρκίνου του προστάτη, του παχέος εντέρου και του μαστού σε πληθυσμιακά περιβάλλοντα. Από τις 587 εργασίες που αξιολογήθηκαν ως προς την επιλεξιμότητα, μόνο 10 συμπεριλήφθηκαν στην αξιολόγηση. Ενθαρρυντικά, 8 από τις 10 μελέτες κατέληξαν στο συμπέρασμα ότι ο προσυμπτωματικός έλεγχος του καρκίνου βάσει PRS ήταν πιθανό να είναι οικονομικά αποδοτικός. Ωστόσο, οι συγγραφείς προειδοποιούν ότι πρέπει να ληφθούν υπόψη ζητήματα όπως το κόστος δημιουργίας, διαχείρισης και αποθήκευσης δεδομένων PRS και το κόστος κατάντη. Απαιτούνται αναλύσεις κόστους-αποτελεσματικότητας για τη χρήση του PRS για άλλες καταστάσεις όπως οι καρδιακές παθήσεις και ο διαβήτης.

Ένα άλλο στοιχείο κλινικής χρησιμότητας είναι η δυνατότητα μεταφοράς του τεστ σε όλους τους πληθυσμούς, ειδικά σε άτομα διαφόρων φυλετικών/εθνοτικών ομάδων και σε άτομα που υποφέρουν από ιατρική άποψη. Τα περισσότερα GWAS, τα οποία αποτελούν τη βάση για το PRS, περιλαμβάνουν κυρίως άτομα ευρωπαϊκής καταγωγής. Αυτή η έλλειψη ποικιλομορφίας στους πληθυσμούς της μελέτης μπορεί να οδηγήσει σε περιορισμένη γενίκευση των αποτελεσμάτων σε άλλους πληθυσμούς και τελικά να επιδεινώσει τις ανισότητες στον τομέα της υγειονομικής περίθαλψης. Προσπάθειες για να διαφοροποίηση δεδομένων στη γονιδιωματική έρευνα είναι σε άνοδο τώρα, αλλά απαιτούνται μελέτες σχετικά με την κλινική χρησιμότητα του PRS σε χώρες χαμηλού έως μεσαίου εισοδήματος.

Σε αυτό Γενετική της Φύσης άρθρο, οι συγγραφείς πρότειναν μια πιθανή θεραπεία σε αυτό το κενό δυνατότητας μεταφοράς, αναπτύσσοντας μια νέα μέθοδο κατασκευής PRS που ενσωματώνει συνοπτικά στατιστικά στοιχεία GWAS από πολλούς πληθυσμούς. Θα χρειαστεί επανεξέταση, επικύρωση και αναπαραγωγή αυτής της μεθόδου.

Τροχός ACCE

Η ανάγκη για περισσότερη αξιολόγηση

Η οικοδόμηση της βάσης αποδεικτικών στοιχείων για τη χρήση του PRS στην κλινική πράξη απαιτεί αξιολόγηση των χαρακτηριστικών απόδοσής τους. ο Μοντέλο CDC ACCE (Εικόνα 1) θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί για το σκοπό αυτό. Το ACCE ήταν α χρήσιμος εργαλείο για την αξιολόγηση της απόδοσης των γενετικών δοκιμών για σχεδόν δύο δεκαετίες. Έχει μια ολοκληρωμένη λίστα στοχευμένων ερωτήσεων που μπορούν να εφαρμοστούν για την αντιμετώπιση ζητημάτων που αφορούν το ΕΝΑαναλυτική εγκυρότητα, ντογραμμική εγκυρότητα και ντογραμμική χρησιμότητα ενός γενετικού τεστ, μαζί με μιηθικές, νομικές και κοινωνικές επιπτώσεις. Πτυχές αυτού του μοντέλου έχουν εφαρμοστεί από διάφορες ομάδες, μεταξύ των οποίων Αξιολόγηση γονιδιωματικών εφαρμογών στην πράξη και την πρόληψη (EGAPP), για την αξιολόγηση γενετικών εξετάσεων. Αν και το ACCE αναπτύχθηκε κατά τη διάρκεια μιας περιόδου που τα γενετικά τεστ αξιολογούσαν συνήθως μόνο μία ή μερικές παραλλαγές γονιδίων τη φορά, τα συστατικά του μοντέλου θα εξακολουθούσαν να εφαρμόζονται σε πιο σύνθετες δοκιμές, συμπεριλαμβανομένου του PRS. Έτσι, το ACCE, ή δυνητικά επαυξημένες και ενημερωμένες εκδόσεις του, θα μπορούσε να αποδειχθεί ένα πολλά υποσχόμενο εργαλείο για την αξιολόγηση της PRS.

Οι PRS έχουν τη δυνατότητα να εγκαινιάσουν μια νέα εποχή γονιδιωματικής στην υγεία του πληθυσμού, μια εποχή στην οποία η γονιδιωματική χρησιμοποιείται όχι μόνο για άτομα με γενετικές διαταραχές, αλλά για όλους. Ωστόσο, για να επιτευχθεί το πλήρες δυναμικό του για βελτίωση της υγείας, το PRS πρέπει να αξιολογηθεί αυστηρά ως προς την κλινική χρησιμότητα, την αποδοτικότητα κόστους και τη δυνατότητα μεταφοράς, καθώς και να εφαρμοστεί δίκαια μεταξύ των πληθυσμών.